Les antivirus et les pare-feu étant des produits incrustés très profondément dans le système d'exploitation, et de nombreuses mises à jour du système d'exploitation, de l'antivirus et du pare-feu ayant eu lieu depuis leurs installations initiales, il est probable que la désinstallation par la procédure standard se passe mal ou laisse des traces un peu partout.

Il est possible que divers services ou pilotes soient encore actifs après la désinstallation et entrent en conflit avec la tentative d'installer un nouvel outil ou une mise à jour.

Ce problème est connu des éditeurs. Ils ont, depuis des années, développé des applications spécialisées permettant d'effacer toutes les traces de tous leurs produits, ne serait-ce que pour permettre une réinstallation fiable de leurs propres produits.