Des fichiers et dossiers (répertoires) ne sont pas visibles dans l'Explorateur Windows. Il s'agit de mettre à l'abri de manipulations malheureuses, par des utilisateurs peu ou pas au fait des arcanes de Windows, certains fichiers essentiels et critiques dont la présence et l'intégrité sont nécessaires au fonctionnement de Windows, des applications, du comportement et de la sécurité de l'ordinateur et des comptes utilisateurs. En fonctionnement normal, cette disposition ne cherche pas à cacher quelque chose mais à protéger quelque chose de légitime. Mais certains virus ou autres formes de malveillances cherchent aussi à se protéger en se rendant invisibles après s'être installés.